當今的氣相色譜儀一般都采用計算機（工作站軟件）進行數據采集和處理，同時也對色譜儀的自動進樣器、柱溫、檢測器、溫度、載氣流速和壓力等色譜參數進行設定和控制，使氣相色譜分析自動化。氣相色譜儀是完成氣相色譜分析的主要工具，因商品規格型號不同，具體操作也不盡相同，用戶可以根據儀器說明書進行操作。

1、加熱

由于氣相色譜儀的生產廠家和質量的不同，設定溫度的方式也不相同，對于用微機設數法或撥輪選擇法給定溫度，一般是直接設數或選擇合適給定溫度值加以升溫，而如果是采用旋鈕定位法則需要按照步驟進行操作。首先過溫定位法，將溫控旋鈕調至低于操作溫度約30℃處，給氣相色譜儀升溫，當過溫至約為操作溫度時，配臺溫度指示和加熱指示燈，再逐漸將溫控旋鈕調至臺適位置。再進行分步遞進定位法，將溫控旋鈕朝升溫方向轉動一個角度，升溫開始，指示燈亮，當溫度基本穩定時，再同向轉動溫控旋鈕，開始繼續升溫，如此遞進調節、直至恒溫在工作溫度上。　　

2、點火　　

氫焰氣相色譜儀、開機時需要點火，有時因各種原因致使熄火后，也需要點火。然而，我們經常會遇到點火不著的情況，下面介紹兩種點火技巧：一是加大氫氣流量法先加大氫氣流量國，點著火后，再緩慢調回工作狀況，此法通用。二是減少尾吹氣流量法，先減少尾吹氣流量，點著火后，再調回工作狀況，此法適用于用氫氣怍載氣，用空氣作助燃氣和尾畋氣情況。